Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG4Q9UBN1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms