Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Gpc6Q9R087 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gpc6Q9R087 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gpc6Q9R087 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gpc6Q9R087 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gpc6Q9R087 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gpc6Q9R087 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gpc6Q9R087 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Gpc6Q9R087 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Gpc6Q9R087 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Gpc6Q9R087 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpc6Q9R087 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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