Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMEM30AQ9NV96 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM30AQ9NV96 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms