Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFA4L2Q9NRX3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms