Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SIK2Q9H0K1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK2Q9H0K1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK2Q9H0K1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms