Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf4Q9DAW6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf4Q9DAW6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms