Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Derl3Q9D8K3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl3Q9D8K3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl3Q9D8K3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl3Q9D8K3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl3Q9D8K3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl3Q9D8K3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl3Q9D8K3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl3Q9D8K3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl3Q9D8K3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms