Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CIPCQ9C0C6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms