Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UPF3BQ9BZI7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPF3BQ9BZI7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms