Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms