Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MYD88Q99836 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYD88Q99836 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYD88Q99836 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MYD88Q99836 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MYD88Q99836 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MYD88Q99836 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
MYD88Q99836 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYD88Q99836 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYD88Q99836 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYD88Q99836 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYD88Q99836 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MYD88Q99836 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYD88Q99836 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYD88Q99836 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYD88Q99836 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MYD88Q99836 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYD88Q99836 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MYD88Q99836 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MYD88Q99836 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYD88Q99836 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYD88Q99836 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYD88Q99836 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYD88Q99836 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYD88Q99836 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MYD88Q99836 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYD88Q99836 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MYD88Q99836 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYD88Q99836 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYD88Q99836 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MYD88Q99836 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MYD88Q99836 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYD88Q99836 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYD88Q99836 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MYD88Q99836 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MYD88Q99836 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYD88Q99836 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYD88Q99836 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYD88Q99836 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MYD88Q99836 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms