Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A4AQ96JQ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms