Protein–RNA interactions for Protein: Q96IZ5

RBM41, RNA-binding protein 41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM41Q96IZ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM41Q96IZ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM41Q96IZ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM41Q96IZ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM41Q96IZ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM41Q96IZ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM41Q96IZ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM41Q96IZ5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM41Q96IZ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM41Q96IZ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBM41Q96IZ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM41Q96IZ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms