Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms