Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKD2Q969F2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKD2Q969F2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms