Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A6Q92581 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A6Q92581 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A6Q92581 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A6Q92581 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A6Q92581 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A6Q92581 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A6Q92581 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A6Q92581 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A6Q92581 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A6Q92581 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC9A6Q92581 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A6Q92581 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms