Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim59Q922Y2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim59Q922Y2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms