Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc9Q8VC31 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms