Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VPS8Q8N3P4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
VPS8Q8N3P4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS8Q8N3P4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms