Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34c1Q8K193 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c1Q8K193 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms