Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD4Q8IYR2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMYD4Q8IYR2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD4Q8IYR2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms