Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pggt1bQ8BUY9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Pggt1bQ8BUY9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Pggt1bQ8BUY9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Pggt1bQ8BUY9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Pggt1bQ8BUY9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pggt1bQ8BUY9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms