Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms