Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN5Q6U736 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OPN5Q6U736 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OPN5Q6U736 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OPN5Q6U736 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN5Q6U736 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN5Q6U736 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN5Q6U736 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN5Q6U736 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN5Q6U736 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OPN5Q6U736 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.1 ms