Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms