Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASC4Q6P4E1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms