Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms