Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RALGAPA1Q6GYQ0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms