Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP1BQ659C4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP1BQ659C4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 724.5 ms