Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CELF3Q5SZQ8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms