Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r195Q5SVD6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms