Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt2Q497M0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt2Q497M0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt2Q497M0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt2Q497M0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samt2Q497M0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samt2Q497M0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samt2Q497M0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samt2Q497M0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samt2Q497M0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms