Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hbq1bQ3U0A6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms