Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BBS9Q3SYG4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms