Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD3Q15054 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD3Q15054 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD3Q15054 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLD3Q15054 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms