Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF235Q14590 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF235Q14590 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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