Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALCAMQ13740 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALCAMQ13740 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALCAMQ13740 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms