Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR4Q13639 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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