Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 TNA1YGR260W 1605 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SFB3YHR098C 2790 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SKN1YGR143W 2316 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 RAD24YER173W 1980 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 IDP1YDL066W 1287 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YDL218WYDL218W 954 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 RPL27BYDR471W 411 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 VFA1YER128W 612 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 RPN12YFR052W 825 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YHR125WYHR125W 306 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 IMP2YMR035W 534 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SCS7YMR272C 1155 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YNG1YOR064C 660 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SEC66YBR171W 621 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 NOT3YIL038C 2511 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YML020WYML020W 1995 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 GCD10YNL062C 1437 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 GZF3YJL110C 1656 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 AVT5YBL089W 1380 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 MCM6YGL201C 3054 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 IRS4YKR019C 1848 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 EMP46YLR080W 1335 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 HOP2YGL033W 657 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 AML1YGR001C 747 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YKE4YIL023C 1041 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SDP1YIL113W 630 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 JLP1YLL057C 1239 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 STM1YLR150W 822 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 FLD1YLR404W 858 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 UBX4YMR067C 1251 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YMR254CYMR254C 309 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YNR021WYNR021W 1215 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 RGS2YOR107W 930 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 DDP1YOR163W 567 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YOR248WYOR248W 303 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 EPS1YIL005W 2106 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 GDI1YER136W 1356 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 ISN1YOR155C 1353 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 QDR3YBR043C 2070 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 ICL1YER065C 1674 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 UGA2YBR006W 1494 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YCR064CYCR064C 411 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 DAD1YDR016C 285 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SEC4YFL005W 648 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YIL077CYIL077C 963 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 DJP1YIR004W 1299 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YVH1YIR026C 1095 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 ATG8YBL078C 354 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YBL112CYBL112C 318 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YBR062CYBR062C 543 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 NAT3YPR131C 588 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YPR197CYPR197C 564 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 ARL1YBR164C 552 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 PBN1YCL052C 1251 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 MID1YNL291C 1647 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SUC2YIL162W 1599 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 HXT4YHR092C 1731 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 ENT2YLR206W 1842 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YDR015CYDR015C 240 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 FIN1YDR130C 876 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 DAL3YIR032C 588 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 NNT1YLR285W 786 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YLR287CYLR287C 1068 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 ECM19YLR390W 339 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YMR122CYMR122C 375 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 LST8YNL006W 912 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YNL109WYNL109W 546 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 CHK1YBR274W 1584 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 TMN2YDR107C 2019 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 OSW2YLR054C 2175 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YDR131CYDR131C 1671 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 QNS1YHR074W 2145 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 VPS70YJR126C 2436 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YER046W-AYER046W-A 330 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YKL131WYKL131W 522 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 ACP1YKL192C 378 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 HLJ1YMR161W 675 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 CMC2YBL059C-A 330 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 RBL2YOR265W 321 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YPL088WYPL088W 1029 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 DSS4YPR017C 432 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 CBP1YJL209W 1965 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 HXT17YNR072W 1695 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 ALT1YLR089C 1779 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 ERG1YGR175C 1491 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SMF1YOL122C 1728 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 PES4YFR023W 1836 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 KNH1YDL049C 807 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 CWC2YDL209C 1020 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YFL051CYFL051C 483 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 RPS20YHL015W 366 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 RPL16AYIL133C 600 nt5.26□□□□□ -1.57
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