Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4DQ08499 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms