Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB2Q08289 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNB2Q08289 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNB2Q08289 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms