Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNK2Q07912 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNK2Q07912 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms