Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CXCL9Q07325 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms