Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cab39Q06138 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms