Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATP7AQ04656 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ATP7AQ04656 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms