Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LystP97412 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LystP97412 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LystP97412 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LystP97412 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LystP97412 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LystP97412 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LystP97412 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LystP97412 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LystP97412 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LystP97412 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LystP97412 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LystP97412 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LystP97412 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LystP97412 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LystP97412 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LystP97412 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LystP97412 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LystP97412 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LystP97412 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LystP97412 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LystP97412 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LystP97412 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LystP97412 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LystP97412 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LystP97412 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LystP97412 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LystP97412 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LystP97412 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LystP97412 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LystP97412 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LystP97412 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LystP97412 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LystP97412 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LystP97412 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LystP97412 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LystP97412 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LystP97412 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LystP97412 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LystP97412 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LystP97412 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LystP97412 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LystP97412 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms