Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SIK1P57059 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIK1P57059 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIK1P57059 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIK1P57059 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIK1P57059 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIK1P57059 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIK1P57059 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIK1P57059 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIK1P57059 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SIK1P57059 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIK1P57059 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIK1P57059 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIK1P57059 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIK1P57059 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIK1P57059 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SIK1P57059 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIK1P57059 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIK1P57059 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SIK1P57059 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SIK1P57059 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIK1P57059 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SIK1P57059 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIK1P57059 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIK1P57059 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIK1P57059 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIK1P57059 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIK1P57059 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIK1P57059 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIK1P57059 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIK1P57059 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIK1P57059 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIK1P57059 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIK1P57059 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIK1P57059 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIK1P57059 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIK1P57059 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIK1P57059 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIK1P57059 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIK1P57059 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIK1P57059 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIK1P57059 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIK1P57059 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIK1P57059 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIK1P57059 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SIK1P57059 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIK1P57059 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIK1P57059 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIK1P57059 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SIK1P57059 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIK1P57059 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIK1P57059 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIK1P57059 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIK1P57059 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIK1P57059 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIK1P57059 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIK1P57059 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIK1P57059 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIK1P57059 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIK1P57059 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIK1P57059 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIK1P57059 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIK1P57059 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIK1P57059 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIK1P57059 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIK1P57059 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms