Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sssca1P56873 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms