Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms