Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB28P51157 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB28P51157 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB28P51157 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB28P51157 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB28P51157 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB28P51157 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB28P51157 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB28P51157 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB28P51157 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB28P51157 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB28P51157 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB28P51157 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB28P51157 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB28P51157 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB28P51157 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB28P51157 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB28P51157 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB28P51157 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB28P51157 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB28P51157 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB28P51157 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB28P51157 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB28P51157 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB28P51157 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB28P51157 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB28P51157 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms